Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp36Q3UFY0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp36Q3UFY0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rrp36Q3UFY0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms