Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A930003A15RikQ3U552 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A930003A15RikQ3U552 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms