Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March9Q3TZ87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
March9Q3TZ87 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March9Q3TZ87 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March9Q3TZ87 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms