Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shcbp1lQ3TTP0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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