Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
D17Wsu92eQ3TT38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
D17Wsu92eQ3TT38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms