Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Echdc2Q3TLP5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Echdc2Q3TLP5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Echdc2Q3TLP5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc2Q3TLP5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms