Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Riiad1Q3KNY5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Riiad1Q3KNY5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms