Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi2Q3I5G5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi2Q3I5G5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxi2Q3I5G5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms