Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lemd1Q14C37 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lemd1Q14C37 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lemd1Q14C37 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms