Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2b3Q0VF55 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp2b3Q0VF55 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms