Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MestQ07646 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MestQ07646 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MestQ07646 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MestQ07646 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MestQ07646 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MestQ07646 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MestQ07646 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MestQ07646 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MestQ07646 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MestQ07646 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MestQ07646 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MestQ07646 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MestQ07646 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MestQ07646 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MestQ07646 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MestQ07646 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MestQ07646 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MestQ07646 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MestQ07646 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MestQ07646 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MestQ07646 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MestQ07646 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MestQ07646 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MestQ07646 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MestQ07646 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MestQ07646 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MestQ07646 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MestQ07646 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MestQ07646 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MestQ07646 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MestQ07646 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MestQ07646 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MestQ07646 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MestQ07646 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MestQ07646 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MestQ07646 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MestQ07646 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MestQ07646 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MestQ07646 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MestQ07646 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MestQ07646 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MestQ07646 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MestQ07646 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MestQ07646 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MestQ07646 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms