Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf9Q07105 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf9Q07105 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf9Q07105 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf9Q07105 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms