Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah2Q06986 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Siah2Q06986 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms