Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx2Q06348 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms