Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPINDOCQ05AH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPINDOCQ05AH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPINDOCQ05AH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPINDOCQ05AH6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.9 ms