Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Caprin2Q05A80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms