Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top1Q04750 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top1Q04750 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top1Q04750 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top1Q04750 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top1Q04750 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top1Q04750 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top1Q04750 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms