Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scg2Q03517 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scg2Q03517 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scg2Q03517 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scg2Q03517 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms