Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Thbs2Q03350 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thbs2Q03350 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms