Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddr1Q03146 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddr1Q03146 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms