Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JupQ02257 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JupQ02257 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JupQ02257 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JupQ02257 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JupQ02257 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JupQ02257 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JupQ02257 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JupQ02257 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
JupQ02257 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JupQ02257 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JupQ02257 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JupQ02257 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JupQ02257 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JupQ02257 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JupQ02257 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JupQ02257 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JupQ02257 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JupQ02257 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JupQ02257 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JupQ02257 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JupQ02257 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JupQ02257 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JupQ02257 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JupQ02257 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JupQ02257 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JupQ02257 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JupQ02257 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JupQ02257 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JupQ02257 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JupQ02257 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JupQ02257 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JupQ02257 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
JupQ02257 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JupQ02257 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JupQ02257 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JupQ02257 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JupQ02257 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JupQ02257 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JupQ02257 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
JupQ02257 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JupQ02257 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JupQ02257 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JupQ02257 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JupQ02257 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JupQ02257 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JupQ02257 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JupQ02257 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JupQ02257 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JupQ02257 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JupQ02257 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JupQ02257 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JupQ02257 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JupQ02257 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JupQ02257 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JupQ02257 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JupQ02257 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JupQ02257 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JupQ02257 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JupQ02257 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JupQ02257 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JupQ02257 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JupQ02257 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JupQ02257 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JupQ02257 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JupQ02257 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JupQ02257 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms