Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1062.9 ms