Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pde4dQ01063 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde4dQ01063 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pde4dQ01063 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde4dQ01063 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pde4dQ01063 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde4dQ01063 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pde4dQ01063 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms