Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms