Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkp1P97350 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pkp1P97350 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms