Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx1P81068 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx1P81068 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx1P81068 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx1P81068 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx1P81068 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx1P81068 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx1P81068 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx1P81068 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx1P81068 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx1P81068 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227 ms