Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CiitaP79621 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CiitaP79621 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CiitaP79621 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CiitaP79621 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CiitaP79621 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CiitaP79621 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CiitaP79621 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CiitaP79621 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms