Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxna1P70206 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxna1P70206 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms