Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2bP62915 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2bP62915 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2bP62915 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms