Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snrpd1P62315 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms