Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrpfP62307 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrpfP62307 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms