Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps11P62281 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps11P62281 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps11P62281 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps11P62281 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps11P62281 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps11P62281 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps11P62281 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps11P62281 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms