Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps29P62274 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps29P62274 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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