Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga11P61622 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga11P61622 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga11P61622 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga11P61622 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga11P61622 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga11P61622 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga11P61622 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms