Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smg6P61406 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smg6P61406 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smg6P61406 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Smg6P61406 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Smg6P61406 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smg6P61406 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Smg6P61406 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smg6P61406 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smg6P61406 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smg6P61406 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smg6P61406 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Smg6P61406 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Smg6P61406 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smg6P61406 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smg6P61406 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms