Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2nP61089 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2nP61089 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2nP61089 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms