Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcif1P59114 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcif1P59114 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms