Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtnsP57757 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtnsP57757 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtnsP57757 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtnsP57757 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtnsP57757 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtnsP57757 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtnsP57757 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms