Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1P56716 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1P56716 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1P56716 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rp1P56716 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rp1P56716 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1P56716 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1P56716 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1P56716 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms