Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NrlP54846 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NrlP54846 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NrlP54846 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NrlP54846 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NrlP54846 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NrlP54846 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NrlP54846 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NrlP54846 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NrlP54846 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NrlP54846 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NrlP54846 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NrlP54846 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrlP54846 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrlP54846 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrlP54846 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NrlP54846 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NrlP54846 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrlP54846 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrlP54846 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrlP54846 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NrlP54846 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NrlP54846 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrlP54846 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrlP54846 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrlP54846 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrlP54846 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrlP54846 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NrlP54846 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrlP54846 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrlP54846 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrlP54846 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NrlP54846 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NrlP54846 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrlP54846 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrlP54846 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrlP54846 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrlP54846 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NrlP54846 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NrlP54846 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrlP54846 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrlP54846 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrlP54846 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrlP54846 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrlP54846 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms