Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Map3k1P53349 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Map3k1P53349 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Map3k1P53349 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Map3k1P53349 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Map3k1P53349 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms