Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upp1P52624 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upp1P52624 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upp1P52624 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upp1P52624 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upp1P52624 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upp1P52624 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upp1P52624 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upp1P52624 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upp1P52624 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upp1P52624 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upp1P52624 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms