Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psen1P49769 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psen1P49769 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen1P49769 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psen1P49769 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen1P49769 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen1P49769 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms