Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mcm4P49717 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcm4P49717 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcm4P49717 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcm4P49717 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms