Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpl13P47963 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpl13P47963 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpl13P47963 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl13P47963 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms