Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nedd4P46935 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nedd4P46935 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nedd4P46935 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms