Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NsfP46460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsfP46460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsfP46460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NsfP46460 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsfP46460 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NsfP46460 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsfP46460 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsfP46460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsfP46460 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsfP46460 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsfP46460 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsfP46460 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsfP46460 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsfP46460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsfP46460 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsfP46460 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsfP46460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms