Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm5cP41230 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Kdm5cP41230 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm5cP41230 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5cP41230 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5cP41230 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms