Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VhlP40338 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VhlP40338 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VhlP40338 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VhlP40338 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VhlP40338 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VhlP40338 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VhlP40338 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VhlP40338 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VhlP40338 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VhlP40338 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VhlP40338 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VhlP40338 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VhlP40338 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VhlP40338 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VhlP40338 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VhlP40338 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VhlP40338 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VhlP40338 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VhlP40338 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VhlP40338 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VhlP40338 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VhlP40338 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VhlP40338 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VhlP40338 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VhlP40338 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VhlP40338 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VhlP40338 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VhlP40338 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VhlP40338 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VhlP40338 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VhlP40338 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms