Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps26aP40336 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps26aP40336 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms